南市近來建案不少，連帶地，也衍生營建廢棄物問題，市府環保局表示，符合環保署規定者，需檢具「事業廢棄物清理計畫書」送環保局審查核准後，始得營運，違反者可處六千元至三百萬元罰鍰。
環保局表示，環保署修正公告「應檢具事業廢棄物清理計畫書之事業」規定中，對於統包或單獨承攬的工程，屬應繳交空氣汙染防制費的營建工程，且興建工程面積達五百平方公尺以上，或工程合約經費為新台幣五百萬元以上；或領有拆除執照的建築物，進行拆除工程且繳交空氣汙染防制費的拆除工程者，都需檢具「事業廢棄物清理計畫書」，經環保局同意後，才能營運。
市長黃偉哲表示，歡迎各地業者來台南加碼投資及建設，為加強管制營建廢棄物流向，避免非法棄置發生，請業者必須依法提送相關計畫書送審。環保局長謝世傑進說，為落實審查及掌握營建廢棄物的流向，對於未報先拆及廢棄物流向不明者，運用網路系統及空拍機現勘，以加強查緝，一０八年共查獲七十七件，針對不法業者，依廢棄物清理法進行相關告發裁處，總裁罰金額達四十六萬二千元整。
