記者王勗∕台南報導
南市環、檢、警於一一三年五月追查養豬場廢汙泥等廢棄物，發現台糖案內畜殖場李姓廠長等幹部、廠商計廿人於廠區回填廢汙泥、營建廢棄物及棄置斃死豬等，檢方一一四年七月依貪汙、廢清法、偽造文書等起訴李等廿名被告。卅一日召開準備庭，李等四名幹部將由合議庭審理外，林姓廠商提出認罪協商，其餘將以簡易審理進行。
一一三年五月間，南市環檢警發現嘉義義竹、彰化二林兩處養豬場廢汙泥申報數量有異，大量廢棄物流向不名，循線追查嘉義、彰化等地廿處土地，發現養豬場人員逕自開挖農、林地，並將廢汙泥、營建廢棄物及斃死豬等就地回填。隨著檢警開挖，發現廢棄物回填深達二至三公尺，土方散發豬糞發酵腐敗臭味，環管署人員也將挖出的廢汙泥採樣送驗。
檢警後循線將案內畜殖場李姓廠長等幹部、廠商等廿人分依貪汙、廢棄物清理法、偽造文書等罪起訴。
台糖後聲明表示，公司將啟動內部檢討，即刻停用涉案傳統畜舍，後續也會全力配合司法機關調查作業。同時已積極投入傳統畜舍改建工程，新畜殖場也將於陸續完工後營運，新廠已規畫化製設備並將依環保單位核定廢棄物清理計畫書執行豬隻廢水處理作業。
台南地院卅一日上午分別召開兩次準備庭，除李姓廠長等四名幹部將由合議庭審理，林姓廠商將由檢方與之研商認罪協商，其餘十五名被告將以簡式審理。李姓廠長及辯護人主張稱案發時台糖無豬糞處理規範，且同時因民眾陳情及討論關廠，總公司當時刪除所有廢棄物處理經費等。
然而對此台糖代理人否認上開說法，強調台糖各場各有廢棄物處理計畫，由各場向各縣市政府提供申請，應該要有計畫，並不是沒有豬糞處理計畫。台南地院也詢問台糖總公司是否存有各場處理計畫，代理人表示將具狀呈報，針對經費遭刪除部分未獲授權說明，也將一併呈報。