防堵武漢肺炎疫情，各醫院都宣布刷健保卡進入醫院，以查核旅遊史，新樓在戶外設發燒檢疫站、管制出入口，成醫則不對外開放民眾停汽機車，建議民眾騎公共自行車T-Bike到院，或搭接駁車到院；奇美醫院則尚處於測試階段，將自十二日開始刷卡入院。
新樓醫院系統各院區包括台南新樓、安南診所、麻豆新樓護理之家等，即日起在醫院急診大門前設置發燒篩檢站、管制出入口外，所有進入醫院的民眾入院均需帶健保卡，利用過卡或輸入身分證字號，查詢旅遊史後，並蓋章才能進入院區，確保安全的就醫環境。醫院於南棟門診大樓大廳入口裝設「紅外線熱像儀」，只要人體溫度超過規定，即會發出警示聲，並需再由工作人員進一步量測耳溫，方能進入。
麻豆新樓醫院則自二月三日開始，實施所有進入醫院民眾，不論病人、家屬，甚至外送人員及廠商，都需要讀取健保卡，至今已實行一週。
成大醫院除了刷卡入院，十日起不對外開放汽機車停車，鼓勵大家多加運用公共交通工具到醫院；如自行開車者，可先將患者放下、到醫院附近停車場停車後，再搭成醫接駁車或騎T-Bike返回醫院。
至於奇美醫院系統刷卡系統還在測試中，將自十二日起正式實施刷健保卡入院，目前進出醫院民眾仍需量體溫、戴口罩。
