一期稻作抽穗了，今年三月初就出現肥料短缺，農民登記預購，但補到的肥料卻不及十分之一，市議員吳通龍到水稻產區農會了解，農民苦訴仍買不到肥料。吳通龍建議政府要有配套措施，別苦了農民。市長黃偉哲表示，預估兩週內將可補足肥缺。
吳通龍指出，前往農會發現農民苦等肥料，農民面對著一期稻作已開始抽穗，卻買不到穗肥而抱怨。日前立委陳亭妃也接獲農民陳情而緊急質詢，農委會則保證「肥料供應不會有問題，且肥料價錢不會調漲」，但至今台南各地區農民持續反映一期稻作所需的肥料還是買不到，且雖然已啟動肥料預購措施，但以重要稻作產區後壁區為例，登記需求六千多包四十公斤肥料，但是至今補貨數量不到五百包，不及農民需求十分之一。
對此，黃偉哲指出，農糧署為解決肥料不足問題，已協調台肥公司儘速供貨，預估兩週內應可補足需求量，據了解，肥料缺貨是因為農民眾預期心理，屯購才會造成短缺；農糧署指出肥料原物料只有百分之三來自中國，其他則來自澳大利亞、印尼、中東等國家，以目前產量可供貨至八月，並陸續進口，農民無需擔心原料短缺與上漲問題。
農業局也表示，對於急需用肥的農友，建議可用單質肥料，即依據台肥公司製作的拌肥指南及配方，混拌成各種複合肥施用，效果與複合肥料相同，且農友購買拌肥用的鉀肥及寶粒磷，台肥公司並贈送桶子及勺子一套，以嘉惠農友。
